Michaelis-Menten Calculator
Enzim reaksiyon kinetiği.
Formula first
Overview
Michaelis-Menten denklemi, reaksiyon hızını bir substratın konsantrasyonuna bağlayarak enzimatik reaksiyonların hızını modeller. Bir enzimin bir substratı bağlayarak bir kompleks oluşturduğu, bu kompleksin daha sonra bir ürüne dönüştüğü ve enzimi serbest bıraktığı bir sistemi tanımlar, sistemin kararlı durumda olduğu varsayılır.
Symbols
Variables
v = Velocity, = Max Velocity, [S] = Substrate Conc, = Michaelis Const
Apply it well
When To Use
When to use: Reaksiyon hızının yüksek substrat konsantrasyonlarında sonunda sabitlendiği basit non-allosterik enzimlerin kinetik parametrelerini belirlemek için bu denklemi uygulayın. Enzim-substrat kompleksinin konsantrasyonunun sabit kaldığını ve ürünün substrata geri dönüş reaksiyonunun ihmal edilebilir olduğunu varsayar.
Why it matters: Bu model, farmakoloji ve ilaç geliştirme için kritik olan enzim verimliliği ve substrat afinitesini anlamak için temeldir. Araştırmacıların maksimum hızın yarısına ulaşmak için gereken substrat konsantrasyonunu temsil eden Km'yi hesaplamasına olanak tanır ve bir enzimin substratını ne kadar sıkı bağladığının standart bir ölçüsünü sağlar.
Avoid these traps
Common Mistakes
- S'yi yanlış birimlerde kullanmak.
- Km'nin paydada eklendiğini unutmak.
One free problem
Practice Problem
Belirli bir enzim katalizli reaksiyonun maksimum hızı (Vmax) 100 µmol/dk ve Michaelis sabiti (Km) 5 mM'dir. Substrat konsantrasyonu (S) 5 mM olduğunda reaksiyon hızını (v) hesaplayın.
Hint: Substrat konsantrasyonu Michaelis sabitine eşit olduğunda, hızın Vmax'ın yarısı olduğunu hatırlayın.
The full worked solution stays in the interactive walkthrough.
References
Sources
- Lehninger Principles of Biochemistry
- Voet & Voet Biochemistry
- Wikipedia: Michaelis–Menten kinetics
- IUPAC Gold Book: Michaelis constant
- IUPAC Gold Book: Michaelis-Menten kinetics
- Lehninger Principles of Biochemistry, 8th Edition (Nelson, D.L., Cox, M.M.)
- Nelson, D. L., Cox, M. M. (2017). Lehninger Principles of Biochemistry (7th ed.). W. H. Freeman.
- Voet, D., Voet, J. G., Pratt, C. W. (2016). Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level (5th ed.). Wiley.