Distanza della Mappa Calculator
Converti la frequenza di ricombinazione in distanza della mappa genetica.
Formula first
Overview
La distanza della mappa rappresenta la disposizione lineare e la spaziatura relativa dei geni lungo un cromosoma basata sulle frequenze di crossing-over. Viene misurata in centimorgan (cM), dove un'unità corrisponde a una probabilità dell'uno percento che si verifichi un evento di ricombinazione genetica tra due loci durante la meiosi.
Symbols
Variables
cM = Map Distance, % = Recombination Frequency
Apply it well
When To Use
When to use: Applica questo calcolo quando interpreti i dati di un testcross a due punti per determinare il linkage genico e il posizionamento cromosomico. Presuppone che gli eventi di ricombinazione avvengano casualmente ed è più accurata per distanze brevi dove è improbabile che si verifichino doppi crossover. Per distanze vicine al 50 cM, sono generalmente necessarie funzioni di mappatura più complesse.
Why it matters: La comprensione delle distanze della mappa consente ai ricercatori di costruire mappe di linkage, che sono essenziali per identificare le posizioni specifiche dei geni associati a malattie ereditarie. Questo metodo ha fornito le basi storiche per la ricerca genomica e continua ad assistere negli studi di agricoltura e biologia evolutiva.
Avoid these traps
Common Mistakes
- Usare decimali invece di percentuali.
- Applicare a grandi distanze.
One free problem
Practice Problem
Un genetista esegue un testcross e identifica che il 15% dei discendenti risultanti esibisce fenotipi ricombinanti per due tratti specifici. Basandosi su questa frequenza di ricombinazione, qual è la distanza stimata della mappa tra questi due geni in centimorgan?
Hint: La relazione tra frequenza di ricombinazione (%) e distanza della mappa (cM) è un rapporto 1 a 1 per geni legati.
The full worked solution stays in the interactive walkthrough.
References
Sources
- Griffiths, Anthony J.F., et al. An Introduction to Genetic Analysis.
- Pierce, Benjamin A. Genetics: A Conceptual Approach.
- Wikipedia: Genetic linkage
- Wikipedia: Centimorgan
- Griffiths, A. J. F., Wessler, S. R., Carroll, S. B., & Doebley, J. (2015). An Introduction to Genetic Analysis (11th ed.). W. H.
- Pierce, B. A. (2020). Genetics: A Conceptual Approach (7th ed.). W. H. Freeman and Company.
- Griffiths, Anthony J.F.; Wessler, Susan R.; Carroll, Sean B.; Doebley, John. Introduction to Genetic Analysis (10th ed.). W.H.
- Standard curriculum — Genetics (Linkage)