Distance de carte Calculator
Convertir la fréquence de recombinaison en distance génétique sur carte.
Formula first
Overview
La distance de carte représente l’agencement linéaire et l’espacement relatif des gènes le long d’un chromosome sur la base des fréquences de crossing-over. Elle est mesurée en centimorgans (cM), où une unité correspond à une probabilité de un pour cent qu’un événement de recombinaison génétique se produise entre deux loci pendant la méiose.
Symbols
Variables
cM = Map Distance, % = Recombination Frequency
Apply it well
When To Use
When to use: Appliquez ce calcul lors de l’interprétation de données issues d’un test-cross à deux points pour déterminer la liaison génétique et le positionnement chromosomique. Il suppose que les événements de recombinaison se produisent aléatoirement et il est plus précis pour les courtes distances où les doubles crossing-over sont peu probables. Pour des distances approchant 50 cM, des fonctions de cartographie plus complexes sont généralement nécessaires.
Why it matters: Comprendre les distances de carte permet aux chercheurs de construire des cartes de liaison, qui sont essentielles pour identifier l’emplacement précis des gènes associés aux maladies héréditaires. Cette méthode a constitué la base historique de la recherche génomique et continue d’aider les études en amélioration agricole et en biologie évolutive.
Avoid these traps
Common Mistakes
- Utiliser une valeur décimale au lieu d’un pourcentage.
- Appliquer à de grandes distances.
One free problem
Practice Problem
Un généticien réalise un test-cross et constate que 15 % des descendants obtenus présentent des phénotypes recombinants pour deux traits spécifiques. D’après cette fréquence de recombinaison, quelle est la distance de carte estimée entre ces deux gènes en centimorgans ?
Hint: La relation entre la fréquence de recombinaison (%) et la distance de carte (cM) est un rapport de 1 pour 1 pour les gènes liés.
The full worked solution stays in the interactive walkthrough.
References
Sources
- Griffiths, Anthony J.F., et al. An Introduction to Genetic Analysis.
- Pierce, Benjamin A. Genetics: A Conceptual Approach.
- Wikipedia: Genetic linkage
- Wikipedia: Centimorgan
- Griffiths, A. J. F., Wessler, S. R., Carroll, S. B., & Doebley, J. (2015). An Introduction to Genetic Analysis (11th ed.). W. H.
- Pierce, B. A. (2020). Genetics: A Conceptual Approach (7th ed.). W. H. Freeman and Company.
- Griffiths, Anthony J.F.; Wessler, Susan R.; Carroll, Sean B.; Doebley, John. Introduction to Genetic Analysis (10th ed.). W.H.
- Standard curriculum — Genetics (Linkage)